San Agustín se encuentra ubicado en el sur del departamento de Huila. Hace parte de la región del Alto Magdalena, resguardado por las primeras estribaciones de las cordilleras central y oriental.

Se erige sobre la parte oriental del macizo colombiano. Su altura es de 1.730 m s. n. m. y su temperatura promedio es de 18 °C.​

Su economía se basa en la producción de café, caña de azúcar, la ganadería y los servicios turísticos y comerciales. Es conocida como «Capital Arqueológica del Huila».

En territorio del municipio se encuentra ubicado el Parque Arqueológico de San Agustín, que es uno de los más importantes espacios arqueológicos en Colombia y el mundo. Este fue declarado Patrimonio de la Humanidad por la Unesco en 1995.

San Agustín es un sitio turístico por excelencia por sus paisajes, su arqueología y su cultura. Aqui se encontraron evidencias de una de las más grandes de las civilizaciones precolombinas representadas en monumentos religiosos y estatuas en piedra talladas de acuerdo con la mitología indígena.

El parque arequológico es considerado la necrópolis mas grande de América; en este lugar se encuentra uno de los yacimientos indígenas más antiguos, grandes e importantes del mundo, es un lugar funerario donde se encuentran una serie de vestigios arqueológicos de un pueblo de escultores y artistas que dejó plasmado todo un testimonio de vida y un pensamiento mitológico, esta data de 3,300 años AC según estudios que se han hecho con el carbono 14 con restos orgánicos encontrados en el parque.